Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TUBB4BP68371 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms