Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UFM1P61960 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UFM1P61960 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UFM1P61960 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UFM1P61960 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
UFM1P61960 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UFM1P61960 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UFM1P61960 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
UFM1P61960 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
UFM1P61960 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms