Protein–RNA interactions for Protein: P57775

FBXW4, F-box/WD repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW4P57775 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
FBXW4P57775 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FBXW4P57775 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW4P57775 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW4P57775 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW4P57775 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW4P57775 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW4P57775 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW4P57775 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW4P57775 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW4P57775 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW4P57775 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FBXW4P57775 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW4P57775 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW4P57775 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FBXW4P57775 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW4P57775 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.08■□□□□ 0
FBXW4P57775 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW4P57775 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW4P57775 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW4P57775 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW4P57775 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW4P57775 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW4P57775 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW4P57775 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW4P57775 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW4P57775 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW4P57775 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW4P57775 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW4P57775 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW4P57775 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW4P57775 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
FBXW4P57775 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW4P57775 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW4P57775 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW4P57775 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW4P57775 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FBXW4P57775 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW4P57775 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW4P57775 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW4P57775 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW4P57775 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW4P57775 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW4P57775 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW4P57775 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW4P57775 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW4P57775 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FBXW4P57775 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW4P57775 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW4P57775 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW4P57775 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW4P57775 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW4P57775 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW4P57775 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.07■□□□□ 0
FBXW4P57775 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW4P57775 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW4P57775 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW4P57775 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW4P57775 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW4P57775 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW4P57775 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
FBXW4P57775 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms