Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AIF1P55008 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AIF1P55008 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AIF1P55008 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AIF1P55008 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AIF1P55008 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AIF1P55008 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AIF1P55008 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AIF1P55008 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AIF1P55008 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AIF1P55008 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AIF1P55008 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AIF1P55008 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AIF1P55008 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AIF1P55008 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AIF1P55008 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AIF1P55008 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AIF1P55008 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AIF1P55008 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AIF1P55008 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AIF1P55008 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AIF1P55008 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AIF1P55008 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AIF1P55008 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AIF1P55008 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AIF1P55008 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AIF1P55008 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AIF1P55008 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AIF1P55008 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AIF1P55008 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AIF1P55008 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AIF1P55008 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AIF1P55008 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AIF1P55008 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AIF1P55008 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AIF1P55008 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AIF1P55008 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AIF1P55008 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AIF1P55008 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AIF1P55008 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AIF1P55008 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AIF1P55008 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AIF1P55008 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AIF1P55008 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AIF1P55008 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AIF1P55008 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AIF1P55008 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AIF1P55008 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AIF1P55008 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AIF1P55008 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AIF1P55008 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AIF1P55008 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
AIF1P55008 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
AIF1P55008 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AIF1P55008 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
AIF1P55008 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms