Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
THOP1P52888 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
THOP1P52888 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
THOP1P52888 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
THOP1P52888 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
THOP1P52888 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
THOP1P52888 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
THOP1P52888 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
THOP1P52888 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
THOP1P52888 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
THOP1P52888 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms