Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NMUP48645 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NMUP48645 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NMUP48645 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
NMUP48645 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NMUP48645 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
NMUP48645 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 DLGAP1-201ENST00000315677 6683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 KCNMA1-216ENST00000457953 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
NMUP48645 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 AJAP1-202ENST00000378191 11666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 ITGA6-202ENST00000409080 5306 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
NMUP48645 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms