Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ME1P48163 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ME1P48163 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ME1P48163 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ME1P48163 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ME1P48163 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ME1P48163 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ME1P48163 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ME1P48163 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ME1P48163 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ME1P48163 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ME1P48163 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ME1P48163 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ME1P48163 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ME1P48163 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ME1P48163 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ME1P48163 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ME1P48163 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ME1P48163 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ME1P48163 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ME1P48163 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ME1P48163 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ME1P48163 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ME1P48163 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ME1P48163 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ME1P48163 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ME1P48163 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ME1P48163 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ME1P48163 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ME1P48163 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ME1P48163 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ME1P48163 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ME1P48163 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ME1P48163 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ME1P48163 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ME1P48163 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms