Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TSFMP43897 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSFMP43897 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSFMP43897 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSFMP43897 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TSFMP43897 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSFMP43897 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TSFMP43897 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSFMP43897 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSFMP43897 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSFMP43897 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSFMP43897 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSFMP43897 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TSFMP43897 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSFMP43897 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSFMP43897 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSFMP43897 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSFMP43897 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSFMP43897 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSFMP43897 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSFMP43897 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSFMP43897 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSFMP43897 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSFMP43897 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSFMP43897 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSFMP43897 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSFMP43897 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSFMP43897 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSFMP43897 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSFMP43897 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSFMP43897 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSFMP43897 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSFMP43897 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSFMP43897 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSFMP43897 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSFMP43897 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSFMP43897 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TSFMP43897 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TSFMP43897 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSFMP43897 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSFMP43897 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSFMP43897 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSFMP43897 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSFMP43897 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSFMP43897 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSFMP43897 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSFMP43897 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSFMP43897 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSFMP43897 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSFMP43897 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TSFMP43897 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms