Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPOP42166 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPOP42166 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPOP42166 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPOP42166 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPOP42166 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPOP42166 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPOP42166 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPOP42166 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPOP42166 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPOP42166 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPOP42166 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPOP42166 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPOP42166 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPOP42166 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPOP42166 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPOP42166 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPOP42166 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPOP42166 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
TMPOP42166 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
TMPOP42166 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPOP42166 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPOP42166 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPOP42166 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPOP42166 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPOP42166 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPOP42166 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPOP42166 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPOP42166 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPOP42166 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPOP42166 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPOP42166 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPOP42166 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPOP42166 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPOP42166 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPOP42166 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPOP42166 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPOP42166 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPOP42166 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPOP42166 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPOP42166 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPOP42166 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPOP42166 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPOP42166 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPOP42166 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPOP42166 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPOP42166 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
TMPOP42166 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPOP42166 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPOP42166 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPOP42166 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPOP42166 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPOP42166 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPOP42166 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPOP42166 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPOP42166 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPOP42166 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPOP42166 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPOP42166 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPOP42166 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPOP42166 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPOP42166 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
TMPOP42166 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms