Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC19A1P41440 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms