Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TRIM23P36406 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms