Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CHI3L1P36222 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CHI3L1P36222 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms