Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CTNNB1P35222 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms