Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ECHS1P30084 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms