Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CASP1P29466 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP1P29466 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP1P29466 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP1P29466 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP1P29466 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP1P29466 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP1P29466 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP1P29466 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP1P29466 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP1P29466 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP1P29466 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP1P29466 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP1P29466 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP1P29466 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP1P29466 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP1P29466 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP1P29466 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP1P29466 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP1P29466 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP1P29466 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP1P29466 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP1P29466 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP1P29466 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP1P29466 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP1P29466 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP1P29466 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP1P29466 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP1P29466 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP1P29466 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP1P29466 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP1P29466 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP1P29466 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP1P29466 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CASP1P29466 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP1P29466 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP1P29466 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CASP1P29466 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP1P29466 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP1P29466 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP1P29466 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP1P29466 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP1P29466 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP1P29466 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP1P29466 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP1P29466 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP1P29466 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP1P29466 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP1P29466 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP1P29466 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP1P29466 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP1P29466 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP1P29466 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP1P29466 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP1P29466 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP1P29466 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP1P29466 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP1P29466 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP1P29466 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP1P29466 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP1P29466 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP1P29466 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP1P29466 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP1P29466 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP1P29466 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CASP1P29466 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms