Protein–RNA interactions for Protein: P29017

CD1C, T-cell surface glycoprotein CD1c, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1CP29017 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD1CP29017 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD1CP29017 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CD1CP29017 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms