Protein–RNA interactions for Protein: P25024

CXCR1, C-X-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR1P25024 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
CXCR1P25024 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms