Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KDELR1P24390 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KDELR1P24390 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KDELR1P24390 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KDELR1P24390 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KDELR1P24390 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KDELR1P24390 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KDELR1P24390 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KDELR1P24390 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KDELR1P24390 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KDELR1P24390 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KDELR1P24390 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KDELR1P24390 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KDELR1P24390 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KDELR1P24390 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KDELR1P24390 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KDELR1P24390 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KDELR1P24390 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KDELR1P24390 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KDELR1P24390 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KDELR1P24390 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KDELR1P24390 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KDELR1P24390 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KDELR1P24390 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KDELR1P24390 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KDELR1P24390 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms