Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPRGP23470 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
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