Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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PTPRBP23467 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PTPRBP23467 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PTPRBP23467 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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PTPRBP23467 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PTPRBP23467 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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