Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNNI3P19429 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms