Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
EPCAMP16422 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EPCAMP16422 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms