Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
HOXD8P13378 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms