Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
COX4I1P13073 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
COX4I1P13073 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms