Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COL6A2P12110 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COL6A2P12110 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms