Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

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Length 1,744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
C4BP0C0L5 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
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