Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
POP4O95707 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
POP4O95707 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
POP4O95707 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms