Protein–RNA interactions for Protein: O75385

ULK1, Serine/threonine-protein kinase ULK1, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK1O75385 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ULK1O75385 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK1O75385 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK1O75385 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK1O75385 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK1O75385 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK1O75385 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK1O75385 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK1O75385 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK1O75385 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK1O75385 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK1O75385 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK1O75385 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK1O75385 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK1O75385 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK1O75385 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK1O75385 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK1O75385 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK1O75385 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK1O75385 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK1O75385 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK1O75385 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK1O75385 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK1O75385 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK1O75385 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK1O75385 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK1O75385 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK1O75385 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK1O75385 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK1O75385 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK1O75385 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK1O75385 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK1O75385 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK1O75385 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK1O75385 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK1O75385 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK1O75385 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ULK1O75385 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ULK1O75385 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms