Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SETD1AO15047 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms