Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
USP17L12C9JPN9 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms