Protein–RNA interactions for Protein: C9JLR9

C11orf95, Uncharacterized protein C11orf95, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf95C9JLR9 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C11orf95C9JLR9 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms