Protein–RNA interactions for Protein: B3KWA1

IDS, Iduronate 2-sulfatase (Hunter syndrome), isoform CRA_e, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDSB3KWA1 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
IDSB3KWA1 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
IDSB3KWA1 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms