Protein–RNA interactions for Protein: A8MPY1

GABRR3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR3A8MPY1 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GABRR3A8MPY1 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms