Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KNCNA6PVL3 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KNCNA6PVL3 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KNCNA6PVL3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KNCNA6PVL3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
KNCNA6PVL3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
KNCNA6PVL3 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
KNCNA6PVL3 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms