Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
KLHL33A6NCF5 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms