Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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KCNIP3Q9Y2W7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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KCNIP3Q9Y2W7 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
KCNIP3Q9Y2W7 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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