Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 RNF139-AS1-202ENST00000519861 359 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 AL591767.1-201ENST00000557160 568 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 AC007216.2-201ENST00000562802 384 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 MTND1P8-201ENST00000571424 950 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LHX6Q9UPM6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms