Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SLC12A4Q9UP95 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SLC12A4Q9UP95 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms