Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN30

SCML1, Sex comb on midleg-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML1Q9UN30 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SCML1Q9UN30 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SCML1Q9UN30 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms