Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms