Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
RABGEF1Q9UJ41 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RABGEF1Q9UJ41 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
RABGEF1Q9UJ41 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
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RABGEF1Q9UJ41 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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RABGEF1Q9UJ41 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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RABGEF1Q9UJ41 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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RABGEF1Q9UJ41 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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RABGEF1Q9UJ41 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RABGEF1Q9UJ41 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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