Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PHF11Q9UIL8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PHF11Q9UIL8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms