Protein–RNA interactions for Protein: Q9UID6

ZNF639, Zinc finger protein 639, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF639Q9UID6 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ZNF639Q9UID6 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms