Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.05■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
COPS7AQ9UBW8 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.05■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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COPS7AQ9UBW8 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
COPS7AQ9UBW8 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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