Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SPASTQ9UBP0 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms