Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COPG2Q9UBF2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms