Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
CCDC88CQ9P219 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CCDC88CQ9P219 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms