Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KCMF1Q9P0J7 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms