Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWF4

SLC52A1, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 1, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A1Q9NWF4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SLC52A1Q9NWF4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SLC52A1Q9NWF4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms