Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SERINC1Q9NRX5 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SERINC1Q9NRX5 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms